历经三个月的谈判后，南京地铁二号线信号系统合同在2007年4月30日正式签订。南京本土的十四所与德国西门子联合体将为南京地铁二号线提供总价为2.46亿元的信号系统设备，该系统的设备国产化率将超过52%。

　　地铁二号线的信号系统与一号线相比有四大技术优势。一是二号线信号系统是一个基于自由无线通信的移动闭塞列车控制系统，该系统采用先进的无线通信技术，在保证安全的前提下能够最大限度的缩短行车间隔，提高线路的行车效率，是世界领先的列车控制系统之一;二是该系统不依靠轨道电路而是利用无线局域网技术实现车地信息的双向传输，同时系统还为PIS系统解决了车地视频信息的传输，避免了信息的相互干扰和传输性能的降低;三是信号系统的安全性、可用性和可靠性有了不同程度的提高，车载设备采用头尾热备冗余的配置方式，使系统的平均无故障时间比单机配置多出数十倍;四是系统提供了比较完备的后备功能，能实现有装备列车与无装备列车的混跑，减少了对运营的影响。