高淳汽车客运站位于南京市高淳区淳溪街道北岭路及丹阳湖北路交会处，于2004年国庆正式营运，按国家交通部二级车站标准建设，占地面积3万平方米，拥有1万平方米的候车室。

车站实现微机联网售票、检票、调度、结算，并设置大屏幕电子显示系统和电子监控系统等设备，具有日发300个班次，接待旅客7000人次的能力。高淳当地居民可以不去市区，直接在该站乘坐开往江苏、浙江、上海和安徽等地的客车。

主要班车为南京南站、南京葛塘、南京禄口机场、南通、无锡（宜兴）、苏州、常州、上海（昆山）、溧阳、溧水、杭州、镇江（句容、天王）、郎溪、宣城、九华山、马鞍山、芜湖、江阴、张家港、常熟、金坛等。

2016年2月4日开通了到南京禄口国际机场的班车，班次时间为：7:00、7:50、8:35、9:25、10:00、10:45、11:25、12:15、13:05、13:55、14:35、15:20、16:10、17:00机场发车：8:30至18:00班次平均间隔仅45分钟价格10元大约1小时，途径线路为宁高新通道(石臼湖特大桥)、S243、S55

2016年2月22日高淳至南通定制客运服务正式上线运营，车型为豪华奔驰商务车，可承载6人，票价188元/人，高淳发车时间：7:30、14:00，南通发车时间：8:00、13:30，全程时长约3个半小时。旅客可下载“巴士管家”手机客户端，自主选择上、下客点和延伸服务点，为自己量身定制路线。

2月26日起，宁高客运班线将进行优化调整，高淳、双牌石分区发车全程高速直达南京。优化后，高淳发出车辆将不再经双牌石配客，双牌石站则变为始发站。车辆流水发班，票价保持不变，行程将缩短15分钟。特别提醒来淳乘客，购票时请说清到高淳还是双牌石，以免误乘。

所有班车经高淳总站始发后均进双牌石汽车站带客（除南京南站、禄口机场方向外）。最早一班为南站的5：30，最后一班为南站的19：00。