在获得2002-2004年度南京市“建设系统文明单位”的基础上，南京地铁总公司2005年又分获2003-2004年度“南京市文明单位”和“江苏省文明单位”荣誉称号。文明单位荣誉称号的获得是对南京地铁牢固树立科学发展观、加快地铁建设与发展、加强公司三个文明建设的充分肯定，是对全体员工发扬艰苦创业、顽强拼搏、开拓进取精神、取得地铁建成开通成果的充分肯定，同时也将使南京地铁再接再厉，以更加昂扬的斗志迎接地铁大发展时期的到来，促进南京地铁在建设三个文明协调发展、构建和谐地铁的征程中不断取得的新成绩。